2017年9月30日前，新建750公里以上污水管网，完成饮用水水源一级保护区内2013年之后新增的38栋违法建筑依法拆除处置，依法关停中央环保督察反馈意见指出的104家工业企业，办结比亚迪公司宝龙工业园废气扰民等5宗案件，出台河长制和生活垃圾分类管理要求，出台全市生态环境保护“党政同责、一岗双责”规定。整改工作取得阶段性成效。
2017年年底前，新建1650公里以上污水管网，完成建成区36条（45段）黑臭水体治理任务，坪山河率先基本达到广东省考核标准。完成2009年6月2日至2013年饮用水水源一级保护区内新增违法建筑的清理工作。
2018年新建1800公里污水管网。2018年年底前，实现茅洲河流域漏排的30万吨生活污水全部收集处理，深圳河、龙岗河、坪山河、观澜河达到地表水Ⅴ类标准，完成饮用水水源一级保护区违法建筑的清理处置。
2019年补齐管网缺口。2019年年底前，东部环保电厂、老虎坑垃圾焚烧发电厂三期和妈湾城市能源生态园项目投入运行，实现原生垃圾零填埋。
2020年年底前，建成较为完善的污水管网体系，茅洲河流域达到地表水Ⅴ类标准，生活垃圾分类和减量达标单位（小区）覆盖率达90%，生活垃圾分类示范学校覆盖率达100%，建成绿色发展先行示范市。