《深圳市轨道交通线网规划（2016-2030）》中已规划的3条轨道交通线。
地铁9号线西延段（高新南-前湾）：由高新南、粤海门、深大南、南山书城、南油、南油西、荔林、怡海、梦海、前湾等10个站点组成；建成通车后，将与地铁5号线南延段、地铁2号线及9号线二期南海大道支线工程组成环南山、蛇口、前海地铁网络，将进一步连接市区、科技园、蛇口、前海等区域。
地铁13号线：穿越南山区和宝安区，起于深圳湾口岸，止于宝安区上屋北村，线路全长约22.4km，全部为地下敷设，设置车站数量不少于14座，将于年内开建，工程建设总工期为5年。
地铁15号线：全长约27km，其起点和终点均为前海，连接南山科技园、宝安中心、后海、前海等重要片区，覆盖科技园南北向交通需求走廊。
点评：13号线、15号线均为南北走向通过科技园，将加强科技园片区与石岩、留仙洞、西丽等地联系。